Общие вопросы

Какая схема у склада, выбранного в выгружаемом заказе клиента, -- ордерная или обычная? И ещё прошу выслать скрин таблицы товаров самого документа.

Попробуйте документ, не загружаемый в ТСД, выгрузить не запросом с ТСД, а нажатием кнопки Выгрузить на вкладке "Обмен данными" на форме обработки в УТ. В каталоге выгрузки будут созданы файлы выгрузки, их прикрепите сюда.

1) Действительно, все выгружаемые в ТСД документы перезаписываются, если их выгрузить заново. Собранные ордера в ТСД в случае загрузки с замещением могут остаться, но работа с ними невозможна, и нужно создавать новые. Старые ордера при этом нужно удалять вручную -- вполне вероятна ситуация, когда вместе с "новым" ордером будет выгружаться и "старый" и, поскольку он уже обработан и относится к несуществующему в ТСД документу, загрузка может отработать с ошибкой. Проверьте, не остаются ли у вас "старые" ордера на ТСД после загрузки с замещением.

2) Файлы, находящиеся в каталоге выгрузки, не выгружаются в ТСД, вместо них при запросе документов на ТСД файлы выгрузки, получаемые через указанные IP и порт, сохраняются во временных каталогах и удаляются после успешной загрузки в ТСД, поэтому нахождение этих файлов в каталоге выгрузки не критично и никаким образом не влияет на процесс обмена.

3) Файлы выгрузки 1С ==> ТСД в вашем случае сформированы корректно.

4) Сформируйте и заскриньте структуру подчинённости документа, который "загружается с ТСД, но никаким образом не обрабатывается в 1С". Для этого, находясь в форме документа, нажмите "Отчёты" ==> "Связанные документы". Результат заскриньте и прикрепите сюда.

При выгрузке ТСД ==> 1С со стороны 1С никаких сообщений об ошибке не выходит внизу окна?
Прикрепите ещё скрин связанных документов заказа клиента с номером 0000-000003, у вас он тоже попадает в выгрузку.