контроль потока данных на USB VCom

Добавляем к примеру различный префикс на каждый сканер и привязываем к одной радиобазе. По данному префиксу будете определять откуда данные пришли.

1. Непонятно каким образом Flow Control поможет Вам распознать какие данные от какого сканера пришли.
2. Вопрос больше не к аппарату, а к производителю драйвера - Silicon Labs. СОМ-порт эмулируется и насколько там точно воспроизведена эмуляция, мы не в курсе, т.к. данную опцию (Flow Control) никогда не использовали.
3. Что мешает задать разные префиксы для разных сканеров, если требуется их идентификация? Например $1$, $2$, $3$ и т.д.
4. Полазил по настройкам. Встроенных средств для идентификации устройств не нашел.

Единественное, что приходит на ум - отключение питания базы. Но тут данные в любом случае потеряются. Если только грызуны перегрызут кабель? И стоит ли овчинка? Я бы больше заботился надежностью между базой и сканером. Хотя производитель утверждает, что если использовать родную базу, то данные однозначно будут на нее получены, либо сканер сообщит, что связи нету и ШК не принят. Со сторонним донглом такого не будет.
Даже больше. Если произошел разрыв между ПО и базой, то первый не переданный ШК будет занесен в память базы, а остальные сканеры будут пищать, что данные передать невозможно. При появлении связи, этот ШК передается. Получается вообще потери никакой нет.
Так что поясните свою фразу "если связь оборвана - данные теряются."

Вы меня окончательно запутали. Программа всегда будет одна. И ей всегда придется парсить префикс. Будь это штатный идентификатор, например, серийный номер или же это префикс назначенный вручную.
Опятьже я пока не понимаю - для чего использовать идентификацию сканеров?
На больших предприятиях оборудование прежде чем попасть к пользователю проходит настройку у системных администраторов. Это их задача вести сводную таблицу соответствия серийных номеров и префикса. Вот у нас по многим причинам невозможно использовать DHCP. Админ ведет таблицу IP и он отвечает за их раздачу. Ничем не отличается от Вашей ситуации.
Я запросил производителя на предмет существования такой идентификации. Но боюсь ответ будет - ставьте префикс.

Хех... Flow control - это настройка порта, а не устройства. И если сервер уйдет в перезагрузку, то настройки... как бы исчезнут. Это сущность ПО, а не физического порта.
Я бы Вам посоветовал рассмотреть такой вариант: работать с памятью сканера. Там 512 Кб и производитель говорит, что можно хранить 32 768 сканов. Это за смену полюбому не собрать. Переключение осуществляется с помощью спец кодов. Затем также с помощью спец кодов выгружаются данные и очищаются. На наших складах кладовщики используют тоже блюзуб сканер (правда уже очень древней модели их сняли с производства давно). База одна. В штатном режиме сканируют в онлайне. Если отходит на соседний склад или вглубь, то сканер автоматически переключается на буферную память (это 4Кб или порядка 250 ШК), при приближении к базе ШК автоматически передаются и пока он доходит до ПК все ШК уже передались. А вот если уходит на другой склад или к машине, то считав 2 спец. ШК переводит сканер в офлайн. Собирает и затем приходит к ПК, переводит сканер в режим передачи, также считав спец. ШК и сбрасывает собранные ШК в программу. Если все прошло удачно, то очищает данные и... переводит в онлайн. В этом случае ШК не пропадут. Правда теряется оперативность, если сбрасывать ШК раз в смену или когда там у вас это возможно.